Mokyklos vėliava yra stačiakampė. Vėliavos plotis 0,90 m, ilgis 1,4 m. Mėlyname fone (centre) įkomponuotas mokyklos pavadinimas ir emblema – baltas vandens lelijos žiedas ir auksinė lyra. Vandens lelija atspindi Ignalinos herbą, lyra simbolizuoja muziką, harmoniją.
Vėliava naudojama per šventes ir renginius.
Ji įpareigoja visus mokyklos bendruomenės narius susitelkti prasmingiems darbams, bendrai mokyklos veiklai.
